课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioconductor
课程简介
《Bioconductor for Genomic Data Science》是约翰·霍普金斯大学提供的一门极富价值的在线课程,特别适合关注基因组数据分析的科研人员和相关领域的工作者。此课程是基因组大数据专项系列的第五门课程,旨在教授使用Bioconductor项目中的多种工具来进行数据分析。
课程大纲
- 第一周:我们将学习如何安装和使用Bioconductor软件,讨论在多种分析中广泛使用的数据结构,包括ExpressionSets、SummarizedExperiment和GRanges。
- 第二周:本周将重点学习如何表示和计算生物序列,无论是全基因组水准还是数百万短读的水准。
- 第三周:这周将包括基本数据类型、ExpressionSet、biomaRt和R S4的学习。
- 第四周:接下来会涵盖如何在Bioconductor中获取数据,以及学习Rsamtools、oligo、limma和minfi的用法。
评测与分析
对于希望深入理解基因组数据分析的学者来说,该课程绝对值得推荐。第一周的内容尤其友好,让缺乏生物信息专业背景的学生也能迅速上手。同时,课程设计注重实践,能够使学生在飞速发展的生物数据环境中游刃有余。
行业专家和教师的讲授风格均让学习变得轻松有趣,而R语言的实际应用使得学员能够快速积累现成技能。学习结束后,在数据科学tie于生 anvi 的实际研究中都将方便应用。同时,优秀的参与者间的讨论也为普通学员提供了丰富的用途与知识补充。
结论
总体而言,我强烈推荐《Bioconductor for Genomic Data Science》这门课。在网络上我们能够较芝麻爛攤筛出合适的学习内容,但是传值得花费的时间去接触。学习之后你将受益匪浅,所获取的技能无疑能助力未来的生物研究。
课程主页: https://www.coursera.org/learn/bioconductor